La misión del CANEF es cultivar las ciencias de la actividad Física, el Deporte y la motricidad Humana mediante la actividad académica.
Promover el saber científico técnico y artístico de las formas de la actividad física que utilizan la motricidad humana como medio de educación permanente, desarrollo personal y social en función del mejoramiento de la calidad de vida.
Orientar el desarrollo académico de las instituciones formadoras de profesionales de la educación física y a otras instituciones vinculadas con la actividad física.
En el ejercicio de su misión, CANEF garantiza el desarrollo cualitativo del conocimiento en el marco de la Ciencias de la Motricidad Humana.